class Copylines
{
int orden = 0;
int numlin =0;
String LineId = "";
String Quantity = "";
String SecQuantity = "";
String QuantityResto = "";
String SecQuantityResto = "";
}

Despues creo este Array

Copylines [] dataNumOfCopies = new Copylines [data.length];

Compañero, la clase esta bien, y cuando creas el vector esta bien, crear tiene que crear un for, para  recorrer el vector y crear una instancia de la clase  {Copylines} en cada posición del vector,  crear una instacia de la clase en cada posición del vector.

for(int ind=0; ind < [data.length]; ind++){

dataNumOfCopies [ind]= new Copylines();

}

hasi en cada posición puedes hacer el llamado de los atributos de la clase

dataNumOfCopies[i].orden = i;


haci evitas este error  java.lang.NullPointerException, este tipo de error indica que no existe  ninguna instacia...