Trisha, la madre de Edward (Ed) y Alphonse (Al) Elric, muere tras una enfermedad muy larga que ocultó en silencio para no preocuparles. Además, su padre, que fue un alquimista bastante notorio, les había abandonado años atrás y ellos vivían con la misma esperanza que su madre: que volvería algún día. Mas esto nunca sucedió, y se desconoce cuál fue su paradero ni el motivo por el que no volvió a buscarles.
Edward y Al, en la inocencia de unos alquimistas jóvenes 11 y 10 años deciden hallar un modo de resucitarla usando la alquimia, sin embargo, la transmutación humana es una ciencia prohibida. Por intentarlo, Ed y Al pagaron un enorme precio: Ed perdió su pierna izquierda en el proceso y Al perdió su cuerpo, obligando a su hermano a sacrificar también su brazo derecho para mantenerlo a duras penas existiendo y sellar el alma de Al en una gran armadura.

Tras ello, más decididos todavía a aprender la transmutación humana (esta vez para recuperar el cuerpo físico de Al y las extremidades de Ed), ambos hermanos se marchan para hacerse Alquimistas Estatales. Su destino final es hallar la Piedra Filosofal , una misteriosa gema que se dice que es capaz de bordear las reglas de la alquimia y su principio de los estados equivalentes: "El hombre no puede tener nada sin dar primero algo a cambio, para tener algo, algo de igual valor debe perderse; esta es la primera ley de la alquimia, la equivalencia de intercambio"